Recoltarea exudatului faringian se realizează corect dimineaţa, înaine de toaleta cavităţii orale şi înainte de a consuma alimente sau lichide. Dacă recoltarea nu se poate efecuta în aceste condiţii, trebuie să existe un interval de aproximativ 3-4 ore de la ultima masă sau ultimul periaj.
Foarte important este ca recoltarea exudatului faringian să se efectueze înainte de începerea tratamentului cu antibiotice sau alte substanţe antibacteriene.
Recoltarea probei pentru efectuarea culturii exudatului faringian se realizează în departamentul de recoltare probe biologice al laboratorului, de către personal calificat.